Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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