Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN3Q13286 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms