Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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