Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA3P52797 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms