Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms