Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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