Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms