Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms