Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms