Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms