Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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