Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLIP2Q9UDT6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms