Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms