Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM5Q9C035 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms