Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms