Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBXN4Q92575 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBXN4Q92575 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBXN4Q92575 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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