Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms