Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF239Q16600 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF239Q16600 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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