Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms