Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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