Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUSP4Q13115 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUSP4Q13115 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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