Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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