Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RAB40BQ12829 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RAB40BQ12829 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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