Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRB1P82279 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRB1P82279 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CRB1P82279 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms