Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NLRP12P59046 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms