Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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