Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYL1P12980 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms