Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASS1P00966 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms