Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACSL4O60488 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms