Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms