Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B4DXG7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B4DXG7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B4DXG7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B4DXG7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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