Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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