Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms