Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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