Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms