Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HDAC11Q96DB2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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