Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KHDC3LQ587J8 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms