Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms