Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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