Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms