Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms