Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC15Q0P6D6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms