Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FPGSQ05932 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms