Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHDQ02161 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHDQ02161 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RHDQ02161 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RHDQ02161 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RHDQ02161 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RHDQ02161 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms