Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CACNA1DQ01668 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms