Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms