Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN10P78369 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms