Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RBX1P62877 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RBX1P62877 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms