Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPD2P43304 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPD2P43304 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms