Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCND2P30279 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCND2P30279 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCND2P30279 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms